近亲结婚存在一定风险。由于家族遗传疾病在亲属间的传递概率增加，孩子可能更容易受到某些遗传疾病的影响。例如，常见的血液疾病如地中海贫血和镰刀细胞贫血都是由基因突变引起的，在近亲结婚中更容易出现。在考虑近亲结婚后进行三代试管时，必须仔细评估家族遗传史并进行相关基因检测。
并非所有近亲结婚都会导致孩子健康问题。事实上，在许多文化中，近亲结婚是常见的现象，并且这些家庭中的孩子通常都是健康的。这是因为虽然近亲结婚会增加遗传疾病的风险，但也有可能带来一些优势。比如，对于一些稀有基因突变，近亲结婚可以提高其传递给下一代的概率，从而减少某些遗传疾病在整个人群中的发生率。
三代试管技术可以帮助解决近亲结婚可能导致的遗传疾病问题。通过三代试管，可以筛查出具体的基因突变，并选择健康的胚胎进行移植。这样一来，即使父母存在携带某种遗传疾病的风险，也能够确保孩子不会受到影响。同时通过选择合适的胚胎进行移植，还可以减少其他可能与近亲结婚相关的健康问题。
在决定是否要进行三代试管前仍需综合考虑伦理、法律等方面因素。近亲结婚及其相关问题在不同文化和国家中有着不同的看法和立法规定。在某些地区，近亲结婚可能被禁止或受到限制。在决定进行三代试管前，需要考虑是否符合当地法律和道德的要求。