囊胚移植作为辅助生殖技术中的一种，其对胎儿的影响主要包括以下几个方面：
优势
避免多胎妊娠
囊胚移植可以避免多胎妊娠的发生。由于囊胚移植的着床能力强，医生通常会选择单囊胚移植，这样可以减少多胎妊娠的风险以及可能发生的减胎术带来的危害。
提高着床率
囊胚的着床率明显高于胚胎的着床率。因此，如果能够顺利培养出能够进行移植的囊胚，就可以大大提高试管婴儿的妊娠率。单囊胚移植不仅可以提高妊娠率，还可以提高妊娠质量。
更符合自然规律
囊胚移植更符合自然受孕时胚胎的着床状态。在自然受孕的情况下，胚胎在第四天左右开始向子宫内移动，在第五到六天开始在子宫内膜上驻扎。因此，移植囊胚实际上更贴近这个自然的规律，可以提高胚胎着床的成功率。
弊端
培养失败风险
囊胚培养并不一定成功，可能会有培养失败的风险。胚胎培养对体外环境要求很高，一般培养至2~3天，可形成卵裂期胚胎，培养到5~7天才形成囊胚。所以囊胚培养意味着体外培养时间的延长，而这个过程，可能会使一部分原本可以着床的胚胎被淘汰掉。
对胚胎的潜在不良影响
虽然囊胚培养可以选择更具发育潜能的胚胎，但是在体外培养过程中，对胚胎表观遗传学功能等方面是否有无不良影响，还有待进一步的研究。
其他因素
嵌合体囊胚移植
嵌合体囊胚移植可能会导致胎儿健康受到影响。嵌合体胚胎是指胚胎的细胞中存在两条或多条不同的染色体，是染色体异常的表现。这种情况下，移植后容易流产、胎停。而且，嵌合体比例越大，移植后妊娠失败的概率越高，婴儿出生后容易出现先天性缺陷或疾病。
PN囊胚移植
PN囊胚移植指的是精子未进入卵子内未受精的情况。在这种情况下，如果第三天胚胎发育情况可以的话，可以继续培养成囊胚，之后再进行移植。但是，0PN胚胎在质量上并不是很好，成功率肯定是要低很多的，而且胎儿发育畸形的概率也比普通胚胎高。
综上所述，囊胚移植在提高试管婴儿妊娠率的同时，也存在一定的风险。因此，在进行囊胚移植前，医生会根据患者的具体条件和胚胎的质量，权衡各种利弊，并给出最适合的治疗方案。