胚胎在早期发育阶段是非常脆弱的。即使通过试管受精排除了一些生理上的问题，仍然存在染色体异常等因素可能导致胚胎无法继续正常发育。据统计，染色体异常是导致自然流产和试管婴儿中断最常见的原因之一。
在试管婴儿过程中，患有慢性疾病或潜在健康问题的女性也更容易出现胎停现象。例如，子宫内膜异位症、甲状腺功能异常、免疫系统紊乱等都可能对孕育健康胚胎产生不利影响。
年龄也是一个重要的因素。随着女性年龄增长，卵巢功能下降并且卵子质量下降的风险增加，这可能导致胚胎无法正常发育。尤其是35岁以上的女性，胎停的风险较高。
孕妇自身的生活方式和饮食习惯也会对试管婴儿的发育产生影响。研究表明，吸烟、酗酒、过度摄入咖啡因等不良习惯都会增加孕育健康胚胎的难度，并增加了胎停的风险。
在试管过程中使用的药物和治疗方法也可能对胚胎发育产生负面影响。例如，一些激素治疗可能导致内分泌失调或子宫内膜异常，进而影响胚胎着床和发育。