南通第三代试管婴儿的花费是相对较高的。试管婴儿它涉及到多个步骤和医疗费用，所以其花费自然会比一般的自然受孕要高。

在南通地区进行试管婴儿需要进行一系列的检查和评估，包括女方的卵巢功能检查、男方的精子检查、子宫内膜厚度等。这些检查的费用大约在500-1000元左右。

南通地区进行试管婴儿需要免费获取辅助生殖技术所需的药物。这些药物包括促排卵药、黄体酮等，价格根据不同个体的情况而有所差异，但大约在5000-10000元之间。

在南通地区进行试管婴儿需要进行体内授精或者胚胎移植（ET）。IVF需要耗费掉大约15000-30000元，而ET则在8000-20000元之间。这些费用包含了医院设备使用、医师操作以及相关药物和护理费用。

还有一些其他额外费用需要考虑。例如如果需要冷冻胚胎或者进行胚胎检测等，费用会有所增加。此外试管婴儿的成功率并不是百分之百，所以可能需要多次尝试，这也会增加花费。