建议巧克力囊肿的患者先通过腹腔镜手术切除巧克力囊肿，等到完全恢复之后再考虑做试管婴儿的手术，因为巧囊也会对试管的成功率造成影响。做试管婴儿之前因为需要打排卵针进行促排卵，如果患者巧克力囊肿比较大，促排卵过程中很可能会刺激囊肿生长，甚至会发生破裂，所以临床上部分医生会视具体情况建议患者先对巧克力囊肿进行治疗后再进行试管。